In Ubuntu, come in tutti i sistemi GNU/Linu, la gestione del traffico di rete è affidata a Netfilter, un componente integrato del kernel.
La gestione di Netfilter normalmente avviene attraverso la riga di comando con iptables.
Uno strumento molto interessante per la gestione del firewall, tramite interfaccia grafica è Firestarter. Grazie a Firestarter è molto semplice impostare le regole regole di filtraggio sulle connessioni.
Un ottima guida di Firestarter è disponibile sul wiki di Ubuntu: http://wiki.ubuntu-it.org/Sicurezza/Firestarter